home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00782 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  29 lines
  1. *************************
  2. * SAR1 family signature *
  3. *************************
  4.  
  5. The SAR1  [1,2]  protein,  first  identified in budding yeast, is a 21 Kd GTP-
  6. binding protein  involved  in  vesicular  transport  between  the  endoplasmic
  7. reticulum and  the  Golgi.  SAR1  is  evolutionary  conserved  and seems to be
  8. present in all eukaryotes.
  9.  
  10. SAR1 is  generally  included  in  the  RAS  superfamily  of  small GTP-binding
  11. protein, but  it  is only  slightly related to the other RAS proteins. It also
  12. differs from RAS proteins in that it lack  cysteine residues at the C-terminus
  13. and is therefore not subject to prenylation. SAR1 is slightly related to ARFs.
  14.  
  15. As a  signature  pattern we selected a conserved region in the C-terminal part
  16. of SAR1.
  17.  
  18. -Consensus pattern: R-x-[LIVM]-E-V-F-M-C-S-[LIVM](2)-x-[KR]-x-G-Y-x-E-[AG]-F-
  19.                     x-W-[LIVM]-x-Q-Y
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22. -Last update: June 1994 / First entry.
  23.  
  24. [ 1] d'Enfert C., Gensse M., Gaillardin C.
  25.      EMBO J. 11:4205-4211(1992).
  26. [ 2] Kuge O., Dascher C., Orci L., Rowe T., Amherdt M., Plutner H.,
  27.      Ravazzola M., Tanigawa G., Rothman J.E., Balch W.E.
  28.      J. Cell Biol. 125:51-65(1994).
  29.